| 序 |
行政規則名稱 |
| 1 | 戒嚴時期不當叛亂暨匪諜審判案件受裁判者及其家屬申請回復名譽作業要點 |
| 2 | 軍事法院辦理九十六年減刑案件應行注意事項 |
| 3 | 軍事法院辦理重大刑事案件應行注意事項（100.08.23 訂定） |
| 4 | 軍事法院檢察署及臺南監獄辦理九十六年減刑案件應行注意事項 |
| 5 | 軍事法院檢察署處理執行案件注意要點（101.11.15 訂定） |
| 6 | 軍事法院檢察署實施全程數位錄音（影）錄製作業要領 |
| 7 | 軍事法院檢察署辦理受刑人分期繳納罰金或易科罰金要點 |
| 8 | 軍事法院檢察署辦理軍法案件聲請羈押注意要點（101.09.05 訂定） |
| 9 |   軍事檢察官與軍法警察（官）執行職務聯繫注意事項 |
| 10 | 軍法案件造成刑事補償事件違失檢討作業要點 |
| 11 | 軍法專刊發行作業規定 |
| 12 | 軍法機關律師登錄作業要點 |
| 13 | 軍法機關辦理刑事案件證人鑑定人日旅費支給要點 |
| 14 | 軍法機關辦理收取及發還刑事保證金應行注意事項 |
| 15 | 國防部各級軍事法院及檢察署辦理刑事補償事件求償作業要點 |
| 16 | 國防部各級軍事法院及檢察署辦理刑事補償金支付作業規定 |
| 17 | 國防部因應行政院軍事冤案申訴委員會專案小組設置及作業要點 |
| 18 | 國防部軍法司辦理捐助法律扶助作業要點 |
| 19 | 國軍輔導訴訟作業要點 |
| 20 | 獎勵檢舉拉法葉艦採購佣金案實施要點（94.11.09訂定） |
| 21 | 檢察機關辦理刑事案件與軍事機關聯繫要點 |